首先压缩机出来的空气温度到冷干机的时候，根据季节的不同在40—50度之间，这个时候的含水份等比较多！进入21世纪，真空冻干技术凭借其它干燥方法无法比拟的优点，越来越受到人们的青睐，除了在、生物制品、食品、血液制品、活性物质领域得到广泛应用。压缩空气的温度降至0℃-8℃，空气中的水份在此温度下析出，通过冷凝器将压缩空气中冷凝出的水分油和杂质分离，通过自动排水器将其排出机外。
冷冻干燥机使用前，先将准备干燥的物品置于低温冰箱或液氮中，使物品完全冰冻结实，方可进行冷冻干燥。主机的右侧板上设有真空泵的电源插座，将真空泵的电源线连接好。检查真空泵，确认已加注真空泵油，不可无油运转。油面不得低于油镜中线。 通常情况下，为了提高超低温真空冷冻干燥机的质量稳定性，生产工厂会结合用户要求与相关标准和气候等因素把超低温真空冷冻干燥机进行标准化。
也有一部分水雾在经过过滤器时被集中和除去。冷冻干燥机过滤器的主要作用是过滤压缩空气中的固体颗粒。从空压机出来的热而潮湿并含有水份的压缩空气首先经过空气对空气热交换器预冷却;然后经过预冷却的空气，在空气对冷媒热交换器被冷干机的冷冻剂循环回路进一步冷却，冷冻干燥就是将含水物质，先冻结成固态，而后使其中的水分从固态升华成气态，以除去水分而保存物质的方法。
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